Фамилия Белюскина — женская форма фамилии Белюскин, а та, в свою очередь, образована по типичной русской модели с суффиксом -ин. Этот суффикс указывает на принадлежность: Белюскин буквально значит «сын Белюски» или «человек из семьи Белюски». Основа здесь — прозвище или нецерковное имя Белюска.

Корень «бел-» в русских прозвищах и фамилиях — один из самых распространённых. Он мог указывать на внешность: светлые волосы, бледную кожу или седину. Форма Белюска — уменьшительно-ласкательная, с суффиксом -юск-, который встречается не так часто, как стандартное -к- (Белка). Такие «ласкательные» прозвища в XV–XVII веках давали детям или младшим членам семьи, и они могли закрепиться как фамилии, если сын продолжал носить прозвище отца.

Менее вероятная, но допустимая версия — связь с диалектным словом «белюс» или «белюсый». В северных и сибирских говорах так называли человека с очень светлыми, почти белыми волосами или ресницами. В этом случае Белюска — вторичное образование от той же основы.

Фамилия редкая и географически не привязана к одному региону. Встречается в разрозненных записях XIX века: от Вологодской губернии до Урала. Это говорит о том, что носители происходили из разных крестьянских или мещанских родов, а не из одной дворянской ветви. В официальных документах фамилия писалась с двумя «с» — Белюскин, хотя в быту могла звучать и как Белюскин, и как Белюзин (с путаницей суффиксов).