Фамилия Бениханова — редкий пример фамилии, образованной не от славянской, а от восточной основы, причём с использованием русского патронимического суффикса -ов. В основе лежит мужское имя Бенихан, которое, по всей видимости, представляет собой сложение двух компонентов: «бен» (в семитских и тюркских языках — «сын», «потомок») и «хан» (тюркский титул, означающий «правитель», «владыка»). Таким образом, имя Бенихан можно расшифровать как «сын хана» или «потомок правителя». В русском языке такие имена нередко адаптировались через прибавление суффикса -ов, который указывал на принадлежность: «чей?» — Бениханов, то есть сын или потомок Бенихана. Отсюда и женская форма Бениханова — супруга или дочь Бениханова.

Словообразовательный суффикс -ов в этой фамилии — классический для русских фамилий, но его сочетание с восточным корнем указывает на то, что носители фамилии, скорее всего, происходят из регионов, где исторически смешивались тюркские, кавказские и славянские традиции именования. Это характерно для народов Северного Кавказа, Закавказья или Поволжья, где в XIX–XX веках под влиянием русской административной системы местные имена и прозвища превращались в фамилии по стандартной модели «имя + -ов/-ев». В данном случае необычность в том, что имя Бенихан само по себе составное и редкое: в нём соединились сразу два элемента, каждый из которых мог быть отдельным именем или титулом.

Географически фамилия Бениханова встречается преимущественно в Дагестане и Чечне, реже — в других республиках Северного Кавказа. Её носители, как правило, принадлежат к кумыкскому, чеченскому или аварскому этносам, где распространены имена с компонентом «хан». В русском языке фамилия закрепилась в женском роде с окончанием -а, что типично для фамилий, перешедших из мужской формы. Если мужчина — Бениханов, то женщина — Бениханова.

Стоит отметить, что фамилия не имеет отношения к еврейскому «Бен-Хаим» или другим семитским конструкциям, хотя внешнее сходство может навести на ложный след. В данном случае «бен» — это не ивритское «сын», а скорее тюркское или персидское заимствование, которое в местных диалектах могло означать «господин» или усиливать значение второго корня. Таким образом, Бениханова — это фамилия, чья этимология лежит на стыке тюркской титулатуры и русской деловой документации, и её появление связано с эпохой, когда у народов Кавказа формировались постоянные родовые имена.