Фамилия Бессекерская — это фонетический вариант более распространённой фамилии Бесекерская. Удвоенная «с» в корне — результат позднейшего произношения или записи, не меняющий сути происхождения. В основе лежит прозвище Бесекерский, которое, в свою очередь, восходит к польскому топониму Бесекеры (Biesiekierzy). Так называлось имение в Ленчицком уезде Калишской губернии (территория современной Польши).

Сам топоним, скорее всего, имеет сложную славянскую структуру, типичную для старых географических названий. Подобно именам вроде Доброслав или Яромир, он состоит из двух смысловых частей. Первая часть, «Бесе-», может быть связана с древнепольским «bies» (бес, чёрт) или с личным именем Бесек (уменьшительная форма от Беслав, Беслав). Вторая часть — «-керы» или «-керзы» — восходит к слову «kierz» (куст, кустарник) в старопольском или западнославянских говорах. Таким образом, Бесекеры можно перевести как «Бесовы кусты» или «кусты Бесека» — прозвищное название места, поросшего густым кустарником.

Именно в этом имении находились развалины старинного замка, основанного в 1500 году Лаврентием Соколовским, воеводой ленчицким. Позже, в 1653 году, его перестроил Иван Семен Щавинский, староста ленчицкий. В Энциклопедии Брокгауза и Ефрона сохранилось описание: стены замка достигали толщины до 3 аршин (больше двух метров), а над воротами и главным входом были вделаны мраморные таблицы с латинской надписью, излагавшей историю здания.

Фамилия Бесекерские (и её вариант Бессекерские) принадлежала польскому дворянскому роду герба Любич. Сведения о носителях фамилии встречаются в архивных документах XX века. В архивах белорусского общества «Мемориал» упоминается поляк Бесекерский Владислав Станиславович, родившийся в 1892 году в городе Згерж (Лодзинское воеводство). А в Книге памяти Хабаровского края записан Бесекерский Михаил Халистратович, 1890 года рождения, уроженец Вильно. Эти записи показывают, что фамилия была распространена как в центральной Польше, так и на восточных окраинах бывшей Речи Посполитой, а в советское время её носители оказались на Дальнем Востоке.