Фамилия Бгодухова — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Чтобы понять её корень, нужно отбросить привычное «бог» и присмотреться к диалектной фонетике. Скорее всего, в основе лежит не слово «Бог», а старинное русское прозвище Бгодух или Бгодушка — так в северных и сибирских говорах называли человека, который «бгает», то есть задыхается, тяжело дышит, пыхтит (от глагола «бгать» — дуть, пыхать). Прозвище давали тому, кто страдал одышкой, быстро уставал от физической работы или имел привычку тяжело вздыхать.

Модель образования проста: к основе Бгодух- добавили суффикс -ов-, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Бгодуха). Женская форма Бгодухова — это либо жена, либо дочь человека с такой фамилией. Суффикс -ов — один из самых массовых в русских фамилиях, но здесь он стоит на редкой, почти уникальной основе.

Версия о связи с «Богом» или «духом» (Бгодухов = «Бога дух») маловероятна. В древнерусском языке слово «Бог» никогда не сокращалось до «Бг-» в корне прозвища, а полная форма Богодух встречается крайне редко и обычно связана с церковными именами (Богодухновенный). Для бытового прозвища такое сложное составное слово нехарактерно. Кроме того, фамилия Бгодухов не фиксируется в дворянских родословных книгах — она явно крестьянская или мещанская, что подтверждает прозвищное, а не религиозное происхождение.

Географически фамилия тяготеет к северу России: единичные носители встречаются в Архангельской, Вологодской областях и в Сибири, куда переселенцы уходили в XVII–XIX веках. В центральных и южных губерниях она практически не встречается. Это дополнительно указывает на диалектный, северный корень «бгать».

Таким образом, носитель фамилии Бгодухова — потомок человека, которого в деревне прозвали за тяжелое дыхание или одышку. Прозвище было точным, запоминающимся и закрепилось в фамилии, несмотря на свою неблагозвучность для современного уха.