Фамилия Бибигон — один из тех редких случаев, когда русская фамилия имеет не просто ясное, а почти литературное происхождение. Вопреки ожиданиям, её основа не связана с древним прозвищем или ремеслом. Бибигон — это вымышленное имя, созданное писателем Корнеем Чуковским для сказочного персонажа, крошечного и хвастливого мальчика-лилипута, который «свалился с Луны». Книга вышла в 1945 году, и имя стало широко известно.

Как фамилия Бибигон могла появиться у реальных людей? Здесь работает механизм прозвища. В семье, где ребёнок был маленьким, подвижным, любил прихвастнуть или придумывать небылицы, его могли в шутку прозвать Бибигоном — по аналогии с героем Чуковского. Прозвище закреплялось за человеком, а затем, при оформлении документов, переходило в фамилию. Это типичная модель для поздних русских фамилий, образованных от прозвищ без добавления суффикса (так называемые «нулевые» фамилии, или фамилии-прозвища).

Словообразовательно фамилия стоит особняком. В ней нет типичных фамильных суффиксов -ов, -ин или -ский. Это так называемая «окаменевшая» форма имени собственного, которая сразу стала фамилией. Сравните с фамилиями Гоголь, Соловей или Баламут — они тоже образованы без суффикса, напрямую от прозвища. Географически фамилия Бибигон встречается крайне редко, в основном в центральной России, и, скорее всего, не имеет древних корней, уходящих глубже середины XX века.

Поскольку фамилия литературная и молодая, в ономастических словарях (например, у Б. Унбегауна или В. Никонова) она не описывается — эти труды охватывают фамилии, сформировавшиеся до XX века. Единственный известный носитель фамилии — сам сказочный персонаж, а все реальные Бибигоны — это потомки людей, чьё прозвище возникло под влиянием популярной детской книги.