Фамилия Бисгаймер — редкий для России случай немецкого происхождения, почти не встречающийся в исконно русской среде. Её не встретишь в словарях русских фамилий, и это сразу подсказывает главное: перед нами не адаптированное крестьянское прозвище, а фамилия, принесённая переселенцами или специалистами из немецкоязычных земель.

В основе лежит географическое название. Бисгаймер — это вариант фамилии, образованной от топонима Бисхайм (Bisheim) или Бисгайм (Bisgheim). Такие названия встречаются в Германии, особенно в землях Баден-Вюртемберг и Рейнланд-Пфальц. Суффикс -er в немецких фамилиях выполняет ту же роль, что русское -ский: он указывает на выходца из определённого места. То есть первый носитель фамилии Бисгаймер — это человек, который либо родился в местечке с таким названием, либо владел там землёй.

Сам топоним Бисгайм, скорее всего, двухосновный. Первая часть восходит к древневерхненемецкому biskof (епископ) или к личному имени Biso. Вторая часть — heim, что значит «дом, поселение, хутор». Таким образом, поселение могло называться «епископским хутором» или «усадьбой Бизо». Фамилия, соответственно, переводится как «тот, кто из Епископского хутора».

В России фамилия могла появиться двумя путями. Первый — через немецких колонистов, которых в XVIII–XIX веках приглашали осваивать Поволжье, Новороссию и Закавказье. Второй — через специалистов (врачей, инженеров, аптекарей), работавших по контракту в крупных городах империи. В обоих случаях фамилия сохраняла исходное написание и произношение, не русифицируясь. Русские суффиксы -ов или -ин к ней не добавлялись, что говорит о позднем и «городском» пути её закрепления.

Ошибочно искать в этой фамилии славянский корень или связь с русским словом «бис» (бес). Созвучие случайно: немецкое Bis- произносится с твёрдым «с», а не с мягким «сь». Единственная спорная деталь — возможное искажение при записи в российских документах: вместо Бисгаймер могли написать Бисгеймер или Бисхаймер, но это лишь графические варианты одной основы.