Фамилия Бобита — редкий случай, когда корень слова ведет не в славянские языки, а в румынский. В его основе лежит мирское имя или прозвище, образованное от румынского bobit (множественное число — bobita), что значит «зернышко». В старину такие «растительные» имена давали детям независимо от сословия: называя младенца Зерном, родители желали ему сытости, здоровья и плодородия — зерно издавна служило символом жизни и вечного обновления.

Разбираем словообразовательную модель. Фамилия оформлена по типичному для восточнороманского ареала принципу: основа bobit + окончание -a. В русской передаче она сохранила исходное звучание без добавления типичных славянских суффиксов (-ов, -ин), что указывает на её относительно позднее закрепление в документах или на иноязычное происхождение носителей.

Есть и вторая, менее вероятная версия. Бобита могло быть не ласковым именем, а прозвищем человека, занятого именно возделыванием зерновых культур. В таком случае фамилия относится к «профессиональным» именованиям, которые указывали на род занятий предка. Однако в пользу первой гипотезы говорит то, что форма bobit скорее уменьшительно-ласкательная, чем описательная: прозвище взрослого работника вряд ли образовали бы от слова «зёрнышко».

Географически фамилия тяготеет к зонам контакта румынского и восточнославянского населения — Молдавия, Буковина, юго-запад Украины. В русских переписных книгах она почти не встречается, что подтверждает её локальный, пограничный характер. Сравните с однокоренными Боб, Бобок, Бобырь — у них славянская основа и другая модель образования, тогда как Бобита сохраняет чужеродный для русского уха суффикс и окончание.