Фамилия Бобрушкина — женская форма фамилии Бобрушкин, и её происхождение не так очевидно, как может показаться на первый взгляд. Самая распространённая ошибка — связывать её с бобром. На самом деле, суффикс -ушк- в русских фамилиях часто указывает не на уменьшительно-ласкательную форму животного, а на происхождение от личного имени или прозвища.

В основе фамилии лежит, скорее всего, некалендарное имя Бобрушка. В старину так могли назвать человека за какую-то внешнюю черту или привычку, но не обязательно связанную с бобром. Например, в некоторых говорах «бобрушкой» называли не только самого зверька, но и человека с пышными, торчащими в стороны усами или с густой, лохматой бородой. Есть и другая версия: прозвище могли дать по роду занятий — бобровому охотнику или торговцу бобровым мехом. Однако в этом случае ожидалась бы фамилия Бобров или Бобровников, а форма с -ушк- указывает на более личное, бытовое прозвище.

Модель образования фамилии типична для северных и центральных областей России. Суффикс -ин (в женском роде -ина) указывает на принадлежность: «чей сын?» — Бобрушкин, то есть сын Бобрушки. Фамилия недворянская, крестьянская или мещанская, и её носительницы, скорее всего, происходят из среды, где прозвища были в ходу до XIX века.

Примечательно, что фамилия Бобрушкина встречается реже, чем однокоренная Бобрусов или Бобрусев. Это говорит о том, что исходное прозвище Бобрушка было локальным, не получившим широкого распространения за пределами одной местности. В современной России фамилия встречается в основном в Поволжье и некоторых областях Центральной России, но нигде не образует плотных гнёзд — носительницы разбросаны по стране.