Фамилия Богомолкины — редкий случай, когда в основе лежит женское прозвище. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Богомолкин, то есть сын или потомок Богомолки. А вот кем была та самая Богомолка — вопрос, на который у историков есть два ответа.

Самое прямое объяснение: Богомолкой называли женщину, которая усердно молилась, часто ходила в церковь или отправлялась в паломничество по святым местам. В русских говорах «богомолка» — то же, что богомолец, только в женском роде. Прозвище могли дать набожной крестьянке, страннице или даже монахине, живущей в миру. Фамилия, образованная от женского прозвища, встречается реже, чем от мужского, но в северных и центральных губерниях России такие случаи не единичны.

Вторая версия — от мирского имени Богомолка, которое давали ребёнку по названию насекомого богомола. На Руси существовала традиция называть детей «обережными» именами от названий животных, птиц и насекомых: Волк, Медведь, Сокол, Богомол. Считалось, что такое имя защищает от злых духов и передаёт ребёнку свойства существа — в случае богомола это хитрость, терпение и умение замирать в ожидании. Однако эта версия менее убедительна: богомол — насекомое южное, в средней полосе России оно редкое, а фамилия Богомолкины встречается в основном в Поволжье и центральных областях, где богомола могли и не видеть.

Словообразовательная модель проста: прозвище Богомолка плюс типичный русский суффикс принадлежности -ин. Фамилия закрепилась в мужской форме Богомолкин, во множественном числе — Богомолкины. Это типичная фамилия крестьянского или мещанского сословия, без дворянских корней. Встречается она нечасто, но устойчиво: носители живут в Нижегородской, Кировской областях и в Удмуртии.

Однокоренные фамилии — Богомолов, Богомольцев, Богомол — образованы от той же основы, но через разные суффиксы. Богомолкины стоят особняком: женский суффикс в основе — редкая деталь, которая сразу выделяет эту фамилию среди «богомольных» соседей.