Фамилия Боговетдинова — редкий случай, когда в основе лежит не просто имя или прозвище, а целое составное слово, причём не славянского, а арабо-персидского происхождения. Если разобрать её на части, получится «Бог» + «вет» + «дин». Средняя часть — «вет» — это искажённое арабское «ваджд» или тюркское «вет» (в диалектном произношении), что означает «нашёл», «обрёл». Вся конструкция «Боговетдин» — это переосмысленная форма мусульманского имени Багаутдин (Багаветдин), где первая часть восходит к тюркскому «бага» (богатый, сильный) или арабскому «баха» (красота, блеск). В итоге имя означает «блеск веры» или «красота религии».

Фамилия образована по стандартной русской модели: к основе «Боговетдин» добавили суффикс -ов, а затем женское окончание -а. Такая русификация — типичный путь для фамилий тюрко-мусульманского населения Поволжья и Приуралья в XIX–XX веках. Когда крестьяне и горожане получали фамилии (часто после отмены крепостного права или при советской паспортизации), их записывали на русский лад: к имени отца или деда прибавляли -ов или -ев.

Географически фамилия Боговетдинова тяготеет к Татарстану, Башкортостану и Оренбургской области. Встречается она редко, и это наводит на мысль, что её носители — потомки одного конкретного человека по имени Багаутдин, который жил в небольшом селе или деревне. Сословно, скорее всего, это были государственные крестьяне или тептяри — сословие, сочетавшее черты земледельцев и военных поселенцев.

Любопытная деталь: в некоторых документах XIX века фамилию могли записывать как «Багаутдинов» или «Боговетдинов» — без удвоения «т» или с заменой «в» на «у». Форма «Боговетдинова» закрепилась, вероятно, из-за местного произношения, где «бага» звучало как «бога» (под влиянием русского слова «бог»), а «ут» редуцировалось до «в». Так имя, означавшее «блеск веры», превратилось в фамилию, которую можно прочитать и как «богом данная вера» — хотя это народная этимология, не имеющая отношения к исходному смыслу.