Фамилия Богумель — редкий случай, когда основа читается почти прозрачно, но точное значение ускользает. На первый взгляд, в ней слышны два корня: «Бог» и «мель» (от «молоть»). Однако в русской ономастике такая модель сложного слова с глагольной частью во втором компоненте — скорее исключение. Правдоподобнее всего, что перед нами украинская или белорусская фамилия, возникшая как прозвище. Вторая часть могла восходить к «мель» в значении «мелкий, неглубокий» или к диалектному «мель» — «мелководье». Тогда прозвище Богумель означало бы человека, который «мелко» или «неглубоко» понимает Бога, то есть не слишком набожного, поверхностного в вере. В народной среде такое прозвище давали с иронией, без злого умысла.

Есть и другая, менее вероятная версия: отчество от имени-оберега. В дохристианской и раннехристианской традиции родители могли назвать ребёнка «Богумель» — то есть «Богу милый», «любимый Богом». Но здесь мешает окончание «-ель»: в славянских именах с корнем «бог» чаще встречаются формы на «-мир» (Богумир), «-слав» (Богуслав) или «-дан» (Богдан). Компонент «-мель» в этом ряду выглядит чужеродно.

Суффикса в фамилии нет — она образована бессуффиксным способом, что характерно для прозвищ, перешедших в фамилии без изменений. Географически фамилия тяготеет к западнорусским и малороссийским землям: встречается в архивах Гродненской, Волынской и Киевской губерний XIX века. В центральной России почти не фиксируется.

С точки зрения словообразования, интересно, что фамилия не обросла типовыми русскими суффиксами -ов/-ев или -ин. Это указывает на позднее закрепление в письменных источниках, когда прозвище уже успело стать наследственным. Если бы предок Богумель жил в Московском государстве в XVI–XVII веках, его потомки почти наверняка получили бы фамилию Богумелев или Богумелин. Этого не случилось — значит, фамилия оформилась на территории, где польская или украинская традиция допускала прозвища в роли родового имени без дополнительных формантов.