Фамилия Болюнова — женская форма, а её мужской вариант Болюнов. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Болюн. В древнерусском языке «болеть» значило не только «хворать», но и «заботиться, страдать, переживать». Отсюда Болюн — человек, который много о ком-то печётся, тревожится, или же, напротив, тот, кого постоянно мучает хворь. Вторая версия, менее вероятная, связывает корень с диалектным «боля» — «зло, беда». Тогда Болюн — человек, приносящий несчастье или, наоборот, оберегающий от него.

Суффикс -ов указывает на типичную русскую патронимическую модель: Болюнов — сын Болюна. Фамилия могла образоваться и от уменьшительной формы крестильного имени Борис (Боря → Болюн), но это лишь предположение без твёрдых лингвистических оснований. Географически фамилия редкая, встречается в основном в центральных областях России и в Поволжье. В документах XVII века упоминаются крестьяне Болюновы в Арзамасском уезде — это одно из старейших письменных свидетельств.

Интересно, что фамилия избежала путаницы с более частыми «Болтунов» или «Болдырев» — возможно, из-за того, что изначально была прозвищной, а не просто патронимической. Если ваш предок носил её до отмены крепостного права, он почти наверняка был крестьянином или посадским человеком, никак не связанным с медициной, несмотря на «болезненный» корень.