Фамилия Бондоская — редкая и нестандартная для русского уха. Её главная загадка в том, что она не вписывается в типичные модели русских фамилий, образованных от крестильных имён или профессий. На первый взгляд, перед нами типичная «географическая» фамилия с суффиксом -ск-, который указывает на принадлежность к местности или населённому пункту. Однако основа «Бондо» не встречается среди известных русских топонимов, что заставляет искать другие пути.

Скорее всего, перед нами фамилия польского или украинского происхождения. В польском языке существует фамилия Będowski (Бендовский), которая со временем могла трансформироваться в Бондовский, а затем в женскую форму Бондоская. Основа «Będ-» восходит к древнепольскому глаголу «będzie» (будет) или к названию местности Będów. В украинском языке возможна связь с прозвищем «Бондар» (бондарь — ремесленник, делающий бочки), но суффикс -ск- в этом случае менее логичен: от «Бондарь» обычно образуется Бондарский, а не Бондоский.

Ещё одна, более экзотическая версия — связь с итальянским словом «bondo» (род ткани) или с грузинским именем Бондо. Но носители фамилии Бондоская в России, судя по скудным данным, концентрируются на юге страны и в центральных областях, что скорее указывает на польско-украинский след, нежели на кавказский или западноевропейский.

Окончание -ая типично для женского варианта фамилии (жена или дочь Бондоского). Мужская форма — Бондоский. Встречается она крайне редко, и в дореволюционных источниках её почти нет, что говорит о позднем оформлении или о том, что фамилия возникла в среде мелкой шляхты или крестьянства на территории бывшей Речи Посполитой, где фамилии на -ский были особенно распространены.