Фамилия Борчалинская — редкий случай, когда географическое происхождение почти не вызывает споров, но сама фамилия ставит перед исследователем несколько неожиданных вопросов. Её основа — топоним Борчалы (или Борчало). Так называлась историческая область на юго-востоке современной Грузии, в бассейне реки Дебед. В XIX веке эта территория входила в Тифлисскую губернию и была известна как Борчалинский уезд. Коренное население — борчалинские азербайджанцы (самоназвание «борчалы»), а также армяне и грузины.

Фамилия образована по типичной для дворянских и разночинных фамилий модели: основа + суффикс -ск- + окончание -ая. Суффикс -ск- в русских фамилиях чаще всего указывает на территориальную принадлежность (князь Курбский — от Курбы, помещик Успенский — от села Успенского). Борчалинская — значит «происходящая из Борчалы» или «относящаяся к Борчалам». Мужской вариант — Борчалинский, но в истории известен именно женский, что почти наверняка говорит о фамилии, закреплённой за женщиной.

Самая правдоподобная версия: фамилия принадлежала дочери или жене дворянина, который владел землями в Борчалинском уезде или служил там. В Российской империи дети и жёны часто получали фамилию по месту службы или владения отца/мужа. Поскольку фамилия звучит по-русски, а не по-тюркски, её носительница, скорее всего, принадлежала к русскому или обрусевшему дворянскому роду, связанному с этим кавказским регионом.

Менее вероятно, но не исключено, что фамилия могла быть искусственной — например, дана воспитаннице закрытого учебного заведения или приёмной дочери в память о месте её рождения. В любом случае, Борчалинская — это не крестьянская и не мещанская фамилия, а скорее знак принадлежности к служилому или поместному сословию, чья биография была привязана к конкретной точке на карте Кавказа.