Фамилия Борюшкина — женская форма, а мужская — Борюшкин. В русской традиции такие фамилии обычно заканчиваются на -ин, если основа оканчивается на -а или -я. Здесь основа «Борюшк» — это уменьшительно-ласкательный суффикс -юшк-, который в дореволюционной России часто добавляли к именам в быту, особенно в крестьянской и мещанской среде.

Самая вероятная основа — мужское имя Борис. В народной речи его сокращали до Боря, а ласковый вариант — Борюшка. Так могли называть ребёнка, подростка или взрослого в семье и среди близких. Фамилия Борюшкин, таким образом, — это «сын Борюшки», то есть потомок человека, которого в обиходе звали уменьшительным именем. Подобная модель распространена: Ивашкин от Ивашка, Петрушкин от Петрушка.

Менее вероятная, но возможная версия — прозвище Борюшка, образованное не от имени, а от слова «бор» (сосновый лес). В этом случае прозвище мог получить человек, живший у бора или в бору. Однако суффикс -юшк- в прозвищах встречается реже, чем в именах, поэтому версия с именем Борис выглядит убедительнее.

В написании фамилии стоит обратить внимание на букву «ю» после «р»: ударение, скорее всего, падает на неё — Борю́шкина. Встречается и вариант с ударением на первый слог — Бо́рюшкина, но он менее характерен для русской ономастики.

Фамилия не относится к числу древних дворянских — её носители, вероятно, были крестьянами или мещанами из центральных или северных губерний России, где суффикс -юшк- в именах был особенно употребителен. Встречается она нечасто, что делает её локальной и семейной.