Фамилия Ботаханов имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркских носителей, а именно выходцев из Золотой Орды: или от печенегов, или от половцев. Соответственно, своими корнями фамилия Ботаханов уходит в XV-XVII вв. Сведения в родословной о восточном происхождении фамилии Ботаханов являются более или менее точными и подтверждаются соответствующими восточным именем ее родоначальника. Фамилия Ботаханов образована от восточного мужского личного имени Ботахан, которое является составным и восходит к двум тюркским словам: «бота», что в переводе на русский язык означает «дитя» и «хан» - «властитель, монарх». Первоначально «хан» обозначал вождя племени (например, у кочевников Ирана и Афганистана). Проникновению инонациональных основ в состав русских фамилий, и в частности в состав фамилии Ботаханов способствовал тот исторический факт, что многие дворяне в России были по своему происхождению нерусскими. Тем не менее, фамилия Ботаханов представляет собой замечательный памятник восточной письменности и культуры.