Фамилия Ботковели — редкий и интригующий случай. В ней сразу заметна нетипичная для русских фамилий концовка «-ели». Такое окончание почти не встречается в исконно русских словообразовательных моделях. Суффиксы -ов, -ев, -ин, -ский, -их, -ых — вот что обычно маркирует русскую фамилию. Форма на «-ели» наводит на мысль о заимствовании или обрусевшей основе из другого языка.

Скорее всего, перед нами фамилия грузинского или, шире, кавказского происхождения. В грузинском языке распространены фамилии на «-ели» (например, Чхеидзе, Гамсахурдия, Орбелиани), но окончание «-ели» в чистом виде тоже встречается, особенно в западно-грузинских регионах, и указывает на принадлежность к местности или роду. Основа «Ботков» может быть производной от грузинского имени или прозвища. Есть грузинское имя «Ботко» (уменьшительное от Ботико, возможно, связанное с «бото» — «боб» или с «бот» — «осёл» в переносном значении «упрямец»). Однако «Ботко» — имя редкое, чаще встречается фамилия Ботков, но уже с русским суффиксом.

Вероятна и другая версия: фамилия могла возникнуть на стыке культур — например, у грузин, живших в русскоязычной среде. Русский суффикс «-ов» добавили к грузинской основе «Ботк», а потом, при обратном заимствовании или под влиянием местного произношения, конечное «-ов» превратилось в «-овели». Такое смешение встречается в фамилиях переселенцев на Кавказ или в среде кубанских и терских казаков, которые контактировали с горскими народами.

Самая простая и правдоподобная гипотеза: фамилия Ботковели — это русифицированная форма грузинской фамилии, где исходный корень (возможно, Ботко или Ботки) получил русский суффикс принадлежности, а потом окончание адаптировалось под местный говор. Носители этой фамилии — потомки выходцев с Кавказа, осевших в России. Географически фамилия почти не встречается за пределами постсоветского пространства, что подтверждает её локальный и относительно недавний характер (XVIII–XIX века). Точную этимологию без записи в метрических книгах или семейного предания установить трудно, но ясно одно: Ботковели — не случайный набор звуков, а след сложного этнического и языкового переплетения.