Фамилия Боюканский — редкая и с первого взгляда неочевидная. Её основа звучит как тюркское или кавказское слово, а суффикс -ский указывает на польское, украинское или белорусское происхождение. Такое сочетание сразу подсказывает, что перед нами не простая крестьянская фамилия, а скорее дворянская или шляхетская, образованная от названия местности.

Разберём суффикс. -ский — типичный формант для фамилий польско-литовской шляхты и украинской старшины. Если бы фамилия была русской, она скорее звучала бы как Боюканов или Боюканцев. Значит, предки Боюканского происходили из тех земель, где были распространены фамилии на -ский: Волынь, Подолье, Гродненщина или Виленщина.

Корень «Боюкан» — самое интересное. Скорее всего, это топоним: название села или местечка. В документах XIX века встречается деревня Боюканы (Boyukany) в Бессарабии, на территории современной Молдовы. Это объясняет и тюркское звучание: «боюк» в тюркских языках значит «большой», «старший». В Молдове и на юго-западе Украины много топонимов с тюркскими корнями, оставшихся от ногайцев или татар. Владелец такого имения или выходец из Боюкан получал фамилию Боюканский.

Есть и другая, менее вероятная версия: основа могла произойти от прозвища Боюкан (от тюркского «боюк» — «великан», «рослый человек»). Но тогда фамилия скорее закрепилась бы как Боюканов, а не Боюканский. Поэтому версия с географическим названием выглядит убедительнее.

Таким образом, носитель фамилии Боюканский с большой вероятностью потомок мелкопоместного шляхтича или казацкой старшины из юго-западных губерний Российской империи, чей род был записан по названию родового гнезда. Фамилия не массовая, редкая, и её обладатели, скорее всего, происходят из одного корня — с территории между Днестром и Прутом.