Фамилия Боюшкова — женская форма фамилии Боюшков, и её разговорный характер выдают сразу два суффикса. Первый, -ушк-, чаще всего встречается в прозвищах и неофициальных именованиях на Русском Севере и в Поволжье: от него образованы слова вроде «милушка», «дедушка» или «боюшка». Второй суффикс, -ов, — стандартный патронимический, указывающий на принадлежность («чей?»). Таким образом, Боюшков — это «сын Боюшки» или «потомок человека по прозвищу Боюшка».

Корень фамилии — глагол «бояться». Прозвище Боюшка могли дать человеку пугливому, осторожному или, наоборот, тому, кого боялись. В русских говорах слово «боюшка» иногда употреблялось как ласковое обращение к тому, кто внушает опасение (например, к медведю, которого старались не называть прямо). Есть и другая, менее очевидная версия: в некоторых диалектах «боюшка» — это «баюшка», то есть тот, кто убаюкивает, нянька. Но семантика страха всё же первична.

Географически фамилия Боюшкова редкая. По данным современных телефонных справочников и архивов ЗАГС, основная масса носителей сосредоточена в Вологодской, Архангельской областях и в Пермском крае — то есть как раз в зоне бытования северорусских говоров с уменьшительным суффиксом -ушк-. Это косвенно подтверждает, что прозвище возникло не в дворянской среде, а среди крестьян или посадских людей.

Сословно фамилия не элитарная. В ревизских сказках XIX века Боюшковы встречаются среди государственных крестьян и мещан. Например, в метрических книгах Шенкурского уезда Архангельской губернии за 1850-е годы записаны крестьяне Боюшковы — это наиболее вероятная среда, где фамилия оформилась.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями (Боязливов, Боязнов), то Боюшков стоит особняком из-за ласкательного суффикса. Он не звучит как оскорбление или диагноз, а скорее как бытовое, даже чуть насмешливое прозвище, которое со временем закрепилось за родом.