Фамилия Божежьян — редкий случай, когда русское по духу прозвище записано с армянским фамильным суффиксом. Основа здесь прозрачна: «Божья» (от «Божий»). Но как именно это слово стало фамилией и почему окончание -ян — главный вопрос, на котором стоит остановиться.

Скорее всего, перед нами не армянская фамилия в классическом смысле, а результат русификации или адаптации. В армянском языке суффикс -ян (или -янц) указывает на принадлежность к роду. Однако слова «божья» в армянском нет. Вероятнее всего, предок носителя получил в русской среде прозвище Божий или Боже — за набожность, кроткий нрав или, наоборот, за какую-то особенность, связанную с церковью. Позже, при записи в документы (особенно на юге России, в среде смешанного населения), к этому прозвищу механически добавили типичный для местных армян фамильный формант -ян. Так возникла гибридная форма: русский корень + армянский суффикс.

Менее правдоподобна версия о чисто армянском происхождении от имени или топонима. Слово «боже» нехарактерно для армянской антропонимии, а попытки вывести фамилию от армянского «баж» (сокол) или «бож» (кисть, гроздь) потребовали бы слишком сильных фонетических натяжек. Поэтому основная гипотеза — это прозвище, «одетое» в армянскую фамильную форму.

В написании встречаются варианты Божьян и Божежян, что подтверждает неустойчивость фиксации на слух. Географически фамилия тяготеет к регионам, где исторически жили кубанские или донские армяне (черкесогаи), а также к югу России и Краснодарскому краю. Носители фамилии — потомки людей, которых в XIX веке в метриках могли записать просто как «Божий», а их дети уже получили фамилию Божежьян.