Фамилия Бугинас — один из тех редких случаев, когда славянская по форме фамилия имеет отчетливое литовское происхождение. Её выдает суффикс -ас, который в русском языке не встречается, а в литовском является типичным окончанием мужского рода в именительном падеже. Это значит, что перед нами не русифицированная, а практически не изменённая литовская фамилия.

Основа фамилии — литовское слово «buginas» или «bugė», которое в диалектах может означать «пугало», «чучело» или, в переносном смысле, «ворчун», «зануда». Вероятнее всего, прозвище Бугис, от которого и пошла фамилия, дали человеку с неспокойным, ворчливым характером или тому, кто внушал страх — например, суровому сторожу или человеку с громким голосом. Встречается и более прозаическая версия: «bugė» — это «пень», «коряга», и прозвище могло относиться к крепкому, коренастому человеку.

Географически фамилия сосредоточена в Литве, а в России встречается в основном на западе — в Калининградской области, а также в Сибири, куда литовцев ссылали в XIX веке или где они оседали в ходе миграций. В отличие от большинства русских фамилий, Бугинас не имеет суффикса принадлежности (-ов, -ин), что сразу указывает на балтское, а не славянское происхождение.

Интересно, что в дореволюционных документах фамилию могли записывать на русский лад — Бугин или Бугинов, но носители, дорожившие своим происхождением, сохраняли исходную форму с окончанием -ас. Так что предки современных Бугинасов — это, скорее всего, литовские крестьяне или ремесленники, получившие прозвище по характеру или внешности.