Фамилия Бугучарский — редкий случай, когда географическая привязка почти очевидна, но точное место вызывает споры. Основа фамилии — топоним Бугучар. Сразу приходит на ум посёлок Бугучар в Воронежской области, но это скорее всего случайное совпадение: название населённого пункта могло возникнуть независимо. Куда вероятнее, что фамилия восходит к названию реки Бугучар в Забайкалье (приток Аргуни) или к урочищу с похожим именем. Формант -ский указывает на типичную модель образования от географического названия: такой суффикс в русских фамилиях чаще всего получали дворяне, священники или выходцы из мест, где это название бытовало. В отличие от патронимических фамилий на -ов/-ев, Бугучарский не говорит об отце-основателе, а прямо сообщает: «тот, кто родом из Бугучара».

Корень «бугучар» — тюркского происхождения. В языках Сибири, например в бурятском или эвенкийском, «бугу» означает «олень», а «чар» — суффикс, указывающий на место или обилие. Таким образом, Бугучар — это «оленье место» или «олений ручей». Предок носителя фамилии мог быть казаком-землепроходцем, который обосновался на таком ручье в Забайкалье, или крестьянином, переселившимся оттуда. Встречается фамилия и в польско-литовском контексте: окончание -ский характерно для шляхты, но без документальных подтверждений связывать Бугучарских с дворянством рискованно. Скорее всего, это поздняя фамилия, закрепившаяся за семьями из сибирских или южнорусских регионов в XIX веке.

Написание фамилии устойчивое, без вариантов вроде «Бугучарсков» или «Бугучарцкий» — это дополнительный аргумент в пользу её топонимического, а не прозвищного происхождения. Если искать однокоренные фамилии, то ближайшие — Бугучаров и Бугучаровский, но они ещё реже. Носителей Бугучарских немного, и сосредоточены они в основном в Сибири и на Дальнем Востоке, что подтверждает забайкальскую версию.