Фамилия Букоткина образована от прозвища Букотка. По одной из версий, оно ведет свое начало от белорусского слова «букота» - «гора округлой формы». Вероятно, прозвище отражало особенности места жительства основателя фамилии (недалеко от горы, на возвышенности). Согласно другой гипотезе, в основу прозвища легло название растения бук - «крупное лиственное дерево». Давая младенцу такое прозвище, как Букотка, родители хотели, чтобы природа воспринимала ребёнка как своего, чтобы к нему перешли те полезные качества, которыми наделён избранный представитель животного или растительного мира. Наконец, нельзя исключать, что прозвище связано с диалектным нарицательным «бук» - «долбленая кадка или корыто, в котором стирают или парят белье». В таком случае прозвище Букотка могло указывать на род деятельности предка: он мог быть плотником. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Букотка, со временем получил фамилию Букоткина.