Фамилия Бусынкин — довольно редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Чтобы понять, откуда она взялась, стоит присмотреться к основе «бусынк-» и типичному для русских фамилий суффиксу -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — сын Бусынки.

Самая вероятная версия связывает фамилию с прозвищем Бусынка. В русских говорах, особенно северных и сибирских, словом «буса» или «бус» называли мелкий дождь, моросящий туман, пыль или даже мучную пыль на мельнице. Человек мог получить прозвище Бусынка по нескольким причинам: либо он был суетливым и «мелким» в делах, либо работал на мельнице и всегда был в мучной пыли, либо, что менее вероятно, родился в пасмурную, дождливую погоду. Уменьшительно-ласкательная форма на -ынк- (-енк-) характерна для севернорусских и сибирских говоров, где такие прозвища были особенно распространены. Бусынкин — буквально «потомок Бусынки».

Менее вероятная, но возможная версия — связь с диалектным глаголом «бусить» (упрямиться, капризничать, делать что-то нехотя). В этом случае Бусынка — прозвище упрямого или медлительного человека. Однако первая версия, связанная с погодой или пылью, встречается в ономастике чаще и кажется более органичной для прозвищной традиции.

В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые часто образовывались от полных форм канонических имён, фамилии на -ин вроде Бусынкина чаще происходят от прозвищ или мирских имён, оканчивающихся на -а/-я. Это указывает на то, что предок носителя фамилии был, скорее всего, крестьянином или ремесленником, а не служилым человеком. Географически фамилия тяготеет к северным и центральным областям России, где такие прозвища фиксировались в писцовых книгах XVII–XVIII веков.

Стоит отметить, что фамилия Бусынкин не имеет отношения к тюркским или другим иноязычным корням, несмотря на созвучие с «бусы» или «бусурман». Это исконно русское образование, построенное по модели «прозвище + фамильный суффикс». Встречаются варианты написания с одной «н» — Бусыкин, но форма с удвоенной «н» (Бусынкин) закрепилась, вероятно, из-за того, что в основе прозвища стояла именно форма на -ынка.