Фамилия Бувоненко — редкий случай, когда прозвище, скорее всего, образовано от глагола со значением «говорить». В её основе лежит украинский или южнорусский глагол «бу́вати» (в значении «бывать, случаться»), но более вероятно — диалектное «бувонити» или «бубоніти», то есть «бормотать, говорить невнятно, ворчать». Суффикс -енко (уменьшительно-патронимический, характерный для Восточной Украины) указывает на потомка: «сын того, кого прозвали Бувоном». Исходное прозвище Бувон получил человек с тихой, неразборчивой речью или тот, кто имел привычку что-то бубнить себе под нос.

Модель образования типична для украинских фамилий XVII–XIX веков, когда суффикс -енко закрепился как основной для обозначения сыновей и потомков. В отличие от русских фамилий на -ов/-ев, украинские на -енко не указывают на сословную принадлежность — их носили и казаки, и крестьяне, и мещане. Поэтому предки Бувоненко могли быть кем угодно: от реестрового казака до пахаря.

Встречается фамилия преимущественно в центральных и восточных областях Украины — Черкасской, Полтавской, Днепропетровской. В России она редка и обычно фиксируется в южных регионах, куда переселялись украинцы. За пределами постсоветского пространства почти не встречается.

Любопытно, что у фамилии нет однозначной «благородной» версии. Никакого польского шляхетского корня или связи с «бувоном» как иноязычным заимствованием. Всё упирается в простое бытовое прозвище, которое закрепилось за родом. Это делает Бувоненко примером «говорящей» фамилии, где звуковая форма прямо отражает характер или привычку первого носителя.