Фамилия Бужунар — редкая, с яркой географической привязкой. Её основа почти наверняка происходит от румынского или молдавского слова «bujor» — «пион». Суффикс «-ar» в румынском языке указывает на профессию или род занятий: «bujinar» — это не просто «тот, кто связан с пионами», а конкретно садовник, выращивающий пионы, или, реже, торговец цветами. Фамилия Бужунар — это, по сути, «сын садовника пионов» или «потомок того, кто разводил пионы».

Словообразовательная модель здесь не типично русская, а восточнороманская. В русском языке суффикс «-ар» тоже встречается (например, «рыбарь», «звонарь»), но в фамилиях он редок и чаще всего заимствован. Бужунар — это не переделка на русский лад, а сохранение исходной молдавской или румынской формы. Поэтому географически фамилия тяготеет к бывшим территориям Бессарабии, Молдове, а также к югу Одесской области и Приднестровью, где исторически сильны молдавские корни.

Ударение, скорее всего, падает на последний слог — Бужуна́р, что типично для румынских фамилий на «-ar» (ср. Кожокарь, Шолтояну). В русском быту ударение могли сместить на второй слог — Бужу́нар, но исходный вариант — с ударным окончанием.

Версия о происхождении от личного имени или прозвища «Бужу» (гипотетически от «бужать» — «гудеть», «жужжать») менее убедительна: в восточнославянских говорах такое слово не фиксируется как распространённое, а суффикс «-нар» для русских прозвищ нетипичен. Гораздо правдоподобнее, что перед нами — профессиональное прозвище, закрепившееся в эпоху, когда ремесленные фамилии только формировались.

Сословная принадлежность предков Бужунар — скорее всего, крестьянская или ремесленная. Садоводство в Молдове и на юге Украины было традиционным занятием, и фамилия могла закрепиться за целым родом, специализировавшимся на выращивании цветов или плодовых деревьев. О дворянском происхождении речи не идёт: в молдавских боярских фамилиях чаще встречаются суффиксы «-еску» или «-яну».