Фамилия Бышенковы (в мужском варианте — Бышенков) образована от личного прозвища и относится к распространённому типу русских фамилий. В её основе лежит прозвище Быш, которое восходит к нарицательному «быша» — так в некоторых славянских говорах называли солнечные лучи, пробивающиеся из-за тучи. Скорее всего, такое прозвище давали открытому, светлому, жизнерадостному человеку, которого сравнивали с долгожданным солнцем.

Обращает на себя внимание суффикс «-енко»: он характерен для украинской и белорусской традиции образования фамилий. В русских землях чаще использовали суффиксы «-ов» и «-ин», поэтому возникновение фамилии Бышенков, по всей видимости, связано с территорией современной Украины или Белоруссии. Затем, в ходе миграций или при переезде в центральные регионы России, форма на «-енко» закрепилась и сохранилась.

О точном месте и времени появления фамилии говорить сложно — процесс формирования фамилий у восточных славян был длительным и растянулся на несколько столетий. Однако можно уверенно сказать, что прозвище Быш и производная от него фамилия — это не единичный случай. В ономастике известны родственные фамилии: Бышев, Бышенцев, Бышиков, а также украинские варианты Бышенко, Бышевский. Все они восходят к той же диалектной основе и указывают на общий источник — прозвище, связанное с образом солнца или света.