Фамилия Чарабураев — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти наверняка связано не с профессией или внешностью, а с манерой речи или поведения. Словообразовательная модель проста: суффикс -ев указывает на русскую или русифицированную фамилию, а корень «чарабура» — это устойчивое звукоподражательное сочетание.

В русских говорах, особенно северных и сибирских, «чарабура» или «чара-бура» означало невнятную, быструю речь, бормотание, тараторение. Отсюда же и «чарабурить» — говорить быстро, сбивчиво, неразборчиво. Скорее всего, Чарабураем в XVI–XVII веках прозвали человека, который говорил скороговоркой, «сыпал словами», или, наоборот, того, кто постоянно ворчал себе под нос. Прозвище было насмешливым, но не обидным — скорее констатирующим особенность.

Версия о тюркском происхождении (от «чара» — чёрный и «бура» — верблюд) выглядит натянутой: в тюркских языках нет устойчивой модели сращения двух корней в прозвище без посредства аффикса. Кроме того, географическое распространение фамилии — преимущественно Центральная Россия и Поволжье, где тюркские заимствования есть, но именно звукоподражательная модель «чара-бура» встречается в русских говорах регулярно.

Окончание -ев, а не -ин, говорит о том, что прозвище Чарабурай было не на «-а», а на твёрдый согласный (Чарабур), и фамилию образовали по типу «чей?» — Чарабураев. Встречаются варианты написания через «о» — Чоробураев, что подтверждает диалектное «аканье» (произношение «о» как «а»). Социальный статус первых носителей, скорее всего, крестьянский или посадский: прозвища такого типа давали в среде, где ценили практическую сметку, а не книжную речь. Дворянских родов с этой фамилией не зафиксировано.