Фамилия Чечубалина — вариант женской формы фамилии Чечубалин, и её разговорное или диалектное происхождение прослеживается довольно отчётливо. В основе лежит прозвище или неканоническое имя Чечубал. Первая часть, «чечу-», скорее всего, восходит к глаголу «чечуть» или «чечурить» в значении «чесать, скрести, царапать», либо к слову «чечуля» — так в некоторых говорах называли неряху или человека с неопрятной, взлохмаченной головой. Вторая часть — «-бал» — может быть тюркским элементом, означающим «ребёнок, дитя» (ср. «бала» в татарском, башкирском), или же просто усилительным, звукоподражательным окончанием, которое добавляли к прозвищам для экспрессии.

Таким образом, Чечубал — это человек, которого дразнили за нечёсаную, торчащую шевелюру или за привычку постоянно чесаться. В русской ономастике фамилии на -ин образуются от основ, оканчивающихся на -а/-я: Чечубал → Чечубалин → Чечубалина. Модель типична для северных и центральных областей России, где прозвища с суффиксом -ин были особенно распространены.

Географически фамилия редкая, встречается в основном в Поволжье и на Урале — регионах активного смешения русского и тюркского населения. Это подтверждает версию о тюркском компоненте в основе: в татарской среде слово «бала» («дитя») часто входило в состав имён и прозвищ (например, Чечбала — «ребёнок-чесотка» или «ребёнок с взъерошенными волосами»). Второй вариант, менее вероятный, но возможный: прозвище могли дать человеку, который «чечурил» (толкал, задевал) «балу» — то есть задирал детей.

Сословная принадлежность предков Чечубалиных, скорее всего, крестьянская или однодворческая. Фамилия не относится к дворянским и не фиксируется в старых родословных книгах. В метрических книгах XIX века она встречается эпизодически, что говорит о локальном, нешироком распространении. В советское время фамилия почти не изменила написания — вариант «Чечубалина» устойчив, без чередования букв, что редкость для фамилий с диалектной основой.