Фамилия Чегирина — это женская форма, но в разговоре о происхождении обычно имеют в виду мужской вариант Чегирин, от которого она образована. В основе фамилии лежит прозвище или нецерковное имя Чегир, а сама фамилия построена по самой распространенной в русском языке модели: к основе на -а, -я добавляется суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — Чегирин, то есть сын или потомок Чегира).

Корень чегир- — один из тех, что вызывает споры у ономатологов, и для него существует несколько правдоподобных объяснений. Самое очевидное и часто встречающееся в русской ономастике — связь с тюркскими языками. В них слово «чегир» (в разных произношениях — чигирь, чегерь) могло означать «водоподъемное колесо», «оросительное устройство» или «вино из риса». Прозвище Чегир могли дать человеку, который работал на таком колесе, обслуживал оросительные системы, либо, что реже, любителю хмельных напитков. Вторая версия — от диалектного русского слова «чегирь» (или «чигирь»), которое в южнорусских говорах (особенно на Дону и Кубани) означало то же самое — водяное колесо для полива. Это указывает на возможное происхождение фамилии из казачьих или южнорусских регионов, где ирригация была частью хозяйства.

Существует и менее очевидная, но интересная гипотеза: прозвище могло быть связано с птицей. В некоторых русских говорах «чегир» или «чегирка» — это местное название одной из мелких птиц (например, чечевицы или чижа), и прозвище могли дать за сходство с ней — по голосу, внешности или повадкам. Филолог Б. Унбегаун в своем «Русском словаре фамилий» относит фамилии с корнем Чегир- к числу тех, что имеют тюркскую основу, не исключая и варианта с диалектным русским словом.

Географически фамилия Чегирина встречается не повсеместно, а тяготеет к югу России и Поволжью — областям, где было сильное тюркское влияние и где слово «чигирь» было в ходу. Встречаются носители в Волгоградской, Ростовской, Астраханской областях, а также на Кубани. Социальный состав предков, скорее всего, был крестьянским или казачьим — люди, чья жизнь была связана с землей и водой.

Таким образом, фамилия Чегирина, скорее всего, происходит от прозвища по роду занятий (работник на водоподъемном колесе) или, реже, по диалектному названию птицы. Она несет в себе отпечаток южнорусского быта и тюркского культурного следа, что делает ее характерным примером фамилии из пограничных земель России.