Фамилия Чехнеева — женская форма фамилии Чехнеев, которая принадлежит к довольно редкому типу русских фамилий с тюркским корнем и русским суффиксом. Основа «чехней» или «чехнай» восходит к тюркскому мужскому имени, распространённому в среде казанских татар и башкир. В тюркских языках «чехнай» (или близкое «чэхнэй») означает «светлый, чистый, ясный» — эпитет, который мог даваться ребёнку как пожелание счастливой и безоблачной судьбы. Таким образом, прозвище Чехней или Чехнай в русской среде XVI–XVII веков могло закрепиться за выходцем из татарской служилой знати или за крещёным татарином.

Обратим внимание на суффикс -ев. В русской антропонимии фамилии на -ев обычно образуются от основ, оканчивающихся на мягкий согласный или на -й. Здесь исходное прозвище Чехней дало форму Чехнеев — буквально «сын Чехнея». Ударение в фамилии, скорее всего, падает на второй слог: Чехне́ев. Женская форма Чехнеева образована по стандартной модели притяжательного падежа.

География фамилии узкая. По данным открытых источников и архивных списков, Чехнеевы встречаются преимущественно в Поволжье — в Татарстане, Башкортостане, а также в Оренбургской и Самарской областях. Это согласуется с тюркским происхождением: именно в этих регионах исторически жили татары и башкиры, переходившие в православие и получавшие русские фамилии по имени отца.

Версия о связи с русским словом «чехол» или «чехлить» маловероятна: в таком случае фамилия звучала бы как Чехлов или Чехлин. Не прослеживается и связь с этнонимом «чех» — для этого основа была бы Чехов. Поэтому тюркская гипотеза остаётся единственной убедительной.

Сословно носители фамилии, вероятно, относились к государственным крестьянам или однодворцам — потомкам служилых людей, охранявших юго-восточные границы России. В метрических книгах XIX века Чехнеевы записаны как крестьяне, реже — мещане. Известных общественных деятелей или знаменитостей с этой фамилией пока не зафиксировано, что делает её типичной «фамилией одного корня» — редкой и локальной.