Фамилия Чемоханов — редкая, с неочевидной этимологией. Чтобы разобраться, откуда она взялась, стоит сразу отбросить версию о тюркском корне «чемо» (такого слова нет) и присмотреться к суффиксу и основе.

Фамилия образована по русской патронимической модели с суффиксом -ов, который указывает на принадлежность: «чей?» — Чемоханов, то есть сын Чемохана. Основа — Чемохан — скорее всего, личное имя или прозвище. В русских говорах и соседних языках встречается глагол «чемохать» — хлестать, бить, стегать (ср. «чемохнуть» — ударить). От него образовалось прозвище Чемохан — драчун, задира, или же человек, который чем-то «стегал» (например, плетельщик кнутов). Модель образования прозвищ на -ан характерна для северных и центральных русских говоров: Болван, Долган, Гулян. Чемохан — из того же ряда.

Вторая, менее вероятная версия — связь с диалектным «чемо» (чело, лоб) или с тюркским именем Чемохан (где «хан» — титул, а первая часть неясна). Но убедительных тюркских параллелей для «Чемо» нет, а «чемохать» — слово живое, зафиксированное в словаре Даля. Поэтому самая правдоподобная версия: предок носителя фамилии получил прозвище Чемохан за драчливый нрав или за ремесло, связанное с хлесткими ударами (скажем, погонщик лошадей или мастер по плетению плетей).

Географически фамилия тяготеет к южнорусским областям — встречается в документах по Воронежской и Курской губерниям, где слово «чемохать» было в ходу. Встречаются варианты написания Чемоханов и Чимоханов (с «и» под влиянием аканья). Сословно — скорее всего, крестьянская или однодворческая фамилия: прозвища на -ан редко давали дворянам.

Итог: Чемоханов — русская фамилия от прозвища Чемохан, связанного с действием «чемохать» (бить, хлестать). Предок мог быть либо задирой, либо человеком, чья работа требовала хлестких движений — пастухом, кучером, ремесленником.