Фамилия Черепковский — одна из тех, что сразу вызывают вопрос: при чём тут череп? На самом деле прямая связь с человеческим черепом маловероятна. В основе фамилии лежит прозвище Черепок, а суффикс -ский указывает на её польское или западнорусское происхождение по модели образования. Такие фамилии чаще всего были дворянскими или шляхетскими, но со временем распространились и среди других сословий, особенно на территории бывшей Речи Посполитой — в Беларуси, на Украине и в западных областях России.

Слово «черепок» в старину имело два основных значения. Первое — осколок глиняной посуды, черепок от горшка. Второе, более редкое и диалектное, — так называли человека с крупной или необычной формой головы, либо того, кто носил разбитую посуду (гончар или мусорщик). Прозвище Черепок могли дать гончару, который работал с черепками, или человеку, торговавшему битой посудой. В говорах северо-западных областей «черепок» иногда значило просто «горшок», так что прозвище могло относиться к коренастому, приземистому человеку — «как горшок».

Фамилия Черепковский — типичный пример патронимической или прозвищной фамилии, оформленной по шляхетской моде. Сначала было прозвище Черепок, от него образовалось отчество Черепков, а затем, с добавлением -ский, возникла фамилия, указывающая на принадлежность роду Черепковых. Такая модель особенно характерна для украинской и белорусской ономастики XVII–XVIII веков, когда многие крестьянские и казацкие фамилии «облагородили» суффиксом -ский, чтобы звучать престижнее.

Встречается фамилия преимущественно на западе Украины, в Беларуси и в южных районах Польши. В России она редка и локализована в основном в Смоленской и Брянской областях — исторических землях, где смешивались восточнославянские и польские традиции имянаречения. Однокоренные фамилии — Черепков, Черепнин, Черепанов — гораздо распространённее, но Черепковский сохраняет свой специфический географический и сословный оттенок.