Фамилия Черняшенко сразу выдает украинское происхождение суффиксом -енко, который в XVI–XVII веках формировал фамилии детей по отцу: «Черняша» или «Черняш» — и его сын, Черняшенко. В основе лежит прозвище Черняш, образованное от прилагательного «черный». В славянской традиции «черный» редко означало цвет волос в прямом смысле, чаще — смуглую кожу, темные глаза или даже социальный статус («черные люди» — крестьяне, тяглое население). В украинских говорах «черняш» могло быть и ласкательным именем для ребенка с темными волосами.

Словообразовательная модель проста: корень «черн-» (от «черный»), суффикс «-яш» (уменьшительно-ласкательный, как в «дружок» — друзяш), и патронимический суффикс «-енко». Иными словами, Черняшенко — буквально «сын Черняша». Такие фамилии типичны для Левобережной Украины, особенно для Полтавской и Черниговской губерний, где фамилии на -енко встречались у всех сословий, включая казацкую старшину.

Редкий нюанс: в отличие от более частых Черняка или Чернова, форма «Черняш» как прозвище почти не встречается в письменных источниках XVII века. Это позволяет предположить, что фамилия могла возникнуть не от прямого прозвища, а от имени Черняша — гипокористики от канонического имени Чернец (редкое монашеское имя) или от диалектного «черня» — так в некоторых регионах называли человека, который работал с углем или сажей. Однако первая версия (от прозвища по внешности) остается основной и поддерживается ономастами как наиболее вероятная.

Географически носители фамилии сосредоточены в Украине и южных областях России, куда переселялись украинские крестьяне в XVIII–XIX веках. В переписях XIX века Черняшенко встречаются среди государственных крестьян и казаков, но не в дворянских родословных книгах — это говорит о преимущественно крестьянском или мещанском происхождении рода.