Фамилия Черныченко — характерный пример украинской модели фамилий на -енко, которая массово формировалась в Поднепровье и Слобожанщине в XVII–XVIII веках. Суффикс -енко изначально был уменьшительным и означал «маленький», «сын» или «ученик», а затем закрепился как фамильный показатель. В основе лежит прилагательное «черный» или прозвище Черный, Черныш — так на Руси называли человека со смуглой кожей, темными волосами, либо того, кто носил черную одежду, например, монаха или крестьянина, не менявшего рабочую рубаху.

В отличие от фамилий Чернов или Чернышов, где суффикс -ов/-ев указывает на принадлежность («сын Черного»), Черныченко — это прямое «сын Черныша» или «маленький Черный». Такая модель была особенно распространена среди казачества и крестьянства Левобережной Украины: фамилия не фиксировала социальный статус, а скорее передавала личную характеристику первого носителя. В реестрах Запорожского войска и переписях Гетманщины встречаются однофамильцы с разными вариантами — Чернышенко, Черниченко, что говорит о живом произношении и местных диалектах.

Корень «черн-» многозначен, и этимологи не исключают, что в отдельных случаях прозвище могло относиться к роду занятий: «черный» человек — простой, незнатный, либо к внешности. Однако самая правдоподобная версия — прозвище по цвету волос или кожи, которое позже закрепилось за потомками. Географически фамилия Черныченко чаще всего встречается в центральных и восточных областях Украины, а также в приграничных регионах России, куда переселялись украинские крестьяне в XVIII–XIX веках.

Социальный контекст фамилии типичен для бывшей Гетманщины: основная масса носителей были казаками или государственными крестьянами, и фамилия не указывала на дворянство. В отличие от фамилий на -ский, которые часто носили шляхтичи, Черныченко осталась «простой» — и в этом её историческая ценность.