Фамилия Чибатарь — один из тех редких случаев, когда прозвище, лёгшее в основу фамилии, прямо указывает на ремесло предка, но с диалектным или искажённым звучанием. В основе лежит слово «чиботарь» — так в южнорусских и украинских говорах называли сапожника, башмачника, мастера по изготовлению обуви. Литературная норма — «чеботарь», от тюркского «чабата» (род кожаной обуви). Фамилия Чибатарь закрепила местное произношение: замена «е» на «и» в первом слоге («чиботарь» вместо «чеботарь») характерна для украинских и белорусских диалектов.

Модель образования проста: это «чистая» форма прозвища, без патронимических суффиксов -ов/-ев или -ин. Такие фамилии (на -арь, -ерь) типичны для украинской и белорусской традиции, где ремесленное прозвище часто становилось фамилией без дополнительных переделок. Сравните: Гончарь, Коваль, Ткач. В русской традиции того же мастера назвали бы Чеботарёвым.

Географически фамилия тяготеет к западнорусским и украинским землям — Черниговщине, Полтавщине, Подолью. Встречается и в Молдове, что неудивительно: румынское «cizmar» (сапожник) не имеет к ней отношения, а вот переселенцы из украинских губерний в XIX веке могли принести фамилию в Бессарабию. Варианты написания — Чебатарь, Чеботарь, Чоботарь — все они восходят к одному корню, и Чибатарь — лишь один из фонетических вариантов, закреплённый в документах.

Таким образом, Чибатарь — фамилия-прозвище по профессии. Предок её носителя был сапожником, но не простым, а, возможно, работавшим с грубой кожей и делавшим «чиботы» — высокие сапоги или башмаки. В старину чеботари составляли отдельный цех, и фамилия эта — не случайная, а прямая запись ремесла в родовом имени.