Фамилия Чичялис — редкий случай, когда внешне славянская форма скрывает почти наверняка литовское или жемайтийское происхождение. Окончание -ис выдает в ней литовскую фамилию, русифицированную при записи в документах Российской империи. В оригинале она звучала бы как Čičalis или Čičelys.

Основа фамилии — литовское слово čiča, которое в диалектах означает «дядя» или «старик», а также может быть детским обращением к отцу. Суффикс -elis (в русифицированной записи — -елис/-ялис) в литовском языке образует уменьшительные или ласкательные формы, а также указывает на принадлежность к роду. Таким образом, Чичялис — это буквально «маленький дядя», «сын дяди» или, в более широком смысле, «потомок Чичи», прозвище человека, которого в семье или общине называли «дядюшкой» или «стариком» за уважение или возраст.

Версия о связи с глаголом čičenti (шептать, бормотать) менее вероятна, хотя и не исключена: прозвище могли дать неразговорчивому человеку. Славянский корень «чич» (как в русских диалектных «чича» — «отец», «чичка» — «тетка») тоже возможен, но именно литовский суффикс -elis окончательно склоняет чашу весов в пользу балтского происхождения.

Носители фамилии Чичялис исторически сосредоточены на территории бывшей Ковенской губернии и в приграничных районах современной Литвы и Беларуси. По сословной принадлежности это, скорее всего, крестьяне или мелкая шляхта (однодворцы), так как литовские фамилии на -ис редко встречались у высшей знати, предпочитавшей польские формы на -ский. В метрических книгах XIX века фамилию могли записывать как Чичелис, Чичолис или Чичалис, пока не закрепилось современное написание через «я».

Сегодня фамилия остается редкой даже в Литве, а за ее пределами встречается в основном у потомков литовских переселенцев конца XIX — начала XX века.