Фамилия Чинибаев — редкий случай, когда географический акцент почти наверняка перевешивает все остальные версии. Основа фамилии — тюркское мужское имя Чинибай, которое состоит из двух частей: «чини» (истинный, верный, подлинный) и «бай» (хозяин, богач, господин). Получается «истинный господин» или «верный богач». Имя известно у казахов, башкир, татар и других тюркских народов, но фамилия Чинибаев с высокой вероятностью указывает на казахские корни. В Казахстане фамилия встречается заметно чаще, чем в России, и имеет прозрачную внутреннюю форму: Чинибай — Чинибаев, по стандартной русской модели патронимических фамилий на -ев.

Суффикс -ев (а не -ов) здесь закономерен: он присоединяется к основам, оканчивающимся на мягкий согласный или й. В имени Чинибай конечный звук «й» переходит в «ев», как в фамилиях Базаев, Каратаев. Модель образования типична для XIX — начала XX века, когда русская администрация и переписчики фиксировали родовые имена кочевого населения по отчеству: сын Чинибая — Чинибаев.

Известны две бытовые версии происхождения прозвища, которые стоит упомянуть, но с оговорками. Первая — от слова «чин» в значении «должность, ранг», якобы «чинибай» — «чиновный бай». Эта версия слабая: в тюркских языках «чин» не имеет административного смысла, а имя образовано от исконного «чын» (истина). Вторая — связь с монгольским «чин» (волк), но для казахской и татарской антропонимии это нетипично, и звуковой переход неочевиден.

В русском контексте фамилия сохранила редкую для славянского уха комбинацию «чини», что иногда приводило к искажениям при записи: можно встретить варианты Ченебаев, Чиныбаев. Однако именно форма Чинибаев закрепилась как основная. Сословно фамилия не элитарна и не крестьянская в классическом понимании: её носители — потомки скотоводов, охотников или воинов степных родов, где имя Чинибай давали с пожеланием честности и достатка.