Фамилия Чижаткин — редкий пример, где сочетаются сразу две уменьшительные формы, что делает её особенно интересной для разбора. В её основе лежит не имя и не профессия, а прозвище от названия птицы — чиж. Но если бы всё сводилось к простому «Чижов» или «Чижиков», фамилия не выглядела бы так необычно.

Словообразовательная цепочка здесь двойная. Сначала от слова «чиж» образовали уменьшительное «чижатка» (так могли называть маленького чижа, птенца или, в переносном смысле, невысокого, юркого человека). Затем к этой основе добавили типичный русский фамильный суффикс принадлежности -ин. Таким образом, Чижаткин буквально означает «сын Чижатки» или «человек из рода Чижатки». Модель «прозвище на -ка + -ин» характерна для северных и центральных областей России, где такие формы бытовали в обиходе.

Вероятнее всего, первый носитель фамилии получил прозвище Чижатка за внешнее сходство с птицей: возможно, за щуплое телосложение, подвижность или пение. В русской традиции прозвища по птицам были очень распространены, но именно форма «Чижатка» встречается редко, что говорит о локальном, возможно, деревенском происхождении фамилии. В официальных документах XIX века такая фамилия могла писаться через «и» или «ы» (Чижаткин/Чижаткин), но современное написание закрепилось в советское время при паспортизации.

Фамилия не относится к дворянским или купеческим — это типичная крестьянская или мещанская фамилия, образованная от уличного прозвища. Её редкость объясняется не только необычной основой, но и тем, что в ходе унификации многие подобные «двойные» уменьшительные формы заменялись на более простые (Чижов, Чижиков). Сегодня Чижаткины встречаются в основном в Поволжье и некоторых областях Центральной России, что подтверждает версию о её местном, а не общерусском происхождении.