Фамилия Чотои — редкая и неочевидная для русского уха. Её происхождение почти наверняка не славянское, и разбирать её по модели «основа + суффикс -ов/-ев» было бы ошибкой. Скорее всего, перед нами фамилия, занесённая в Россию из тюркских или кавказских языков, где она сохранила свою оригинальную форму без типичных русских окончаний.

Вероятнее всего, основа «Чотои» восходит к тюркскому личному имени или прозвищу. В тюркских языках (особенно в алтайской, киргизской, казахской среде) есть имя Чото (или Чот), а суффикс -ой может быть либо патронимическим показателем («сын Чота»), либо частью сложного имени. Например, у киргизов известен исторический персонаж Чотой (батыр, герой эпоса «Манас»). Если фамилия происходит от этого имени, то Чотои — это «потомок Чотоя» или «относящийся к Чотою». В таком случае носители фамилии — выходцы из тюркских кочевых народов, возможно, предки были воинами или скотоводами.

Менее вероятная, но возможная версия — кавказские корни. В некоторых языках Дагестана (например, в аварском) встречаются фамилии на -ой, которые указывают на принадлежность к определённому тухуму (роду) или селению. Если «Чотои» — это русифицированная запись, то изначально фамилия могла звучать как ЧIотой или Чутуй. В этом случае географическая привязка — горные районы Дагестана или Чечни.

В русском контексте фамилия Чотои — яркий маркер миграции. Она почти не встречается в центральных областях России, но может быть зафиксирована в Сибири или на юге Урала, куда в XIX–XX веках переселялись тюркские народы. Единственное, что можно утверждать наверняка: перед нами не искусственная фамилия, а живое родовое имя, которое пришло в русский язык без перевода и переосмысления.