Фамилия Чотпаев — редкий пример, где основа почти наверняка не славянская, а тюркская. Суффикс -ев указывает на русскую модель образования (принадлежность «чей?»), но корень «Чотпай» явно заимствован. Скорее всего, это русифицированная форма фамилии, бытовавшей у народов Северного Кавказа, Поволжья или Средней Азии.

Происхождение основы стоит искать в тюркских языках. Наиболее вероятная версия: от личного имени Чотпай, которое могло быть составным. Первая часть «чот» (или «чот») в ряде тюркских наречий означает «мера», «предел» или «граница». Вторая часть «-бай» — распространенный компонент тюркских имен, означающий «богатый», «господин», «хозяин». Таким образом, Чотпай — это «богатый мерой» или «хозяин границы», то есть имя-пожелание достатка и статуса. Встречается и вариант, где «чот» восходит к слову «чот» (один, единица), что в сочетании с «бай» могло означать «первый богач» или «единственный господин».

С точки зрения географии, фамилия Чотпаев и её исходные формы (Чотпай, Чотбаев) фиксируются преимущественно среди чеченцев, ингушей, а также у народов Дагестана. Это указывает на то, что предки носителя фамилии, вероятно, были выходцами с Северного Кавказа, где подобные антропонимы с компонентом «-бай» нередки, хотя в русской записи они адаптировались под фамильную модель на -ев. Социальный контекст: в XIX веке такие фамилии часто получали представители зажиточных слоев или уважаемые старейшины, чье прозвище или имя закреплялось за потомками.

В отличие от многих фамилий, у Чотпаева нет очевидной параллели в славянских языках, и попытки вывести корень из русского диалектного слова (например, от «чот» как «счёт») будут натяжкой. Фамилия — яркий пример того, как тюркское имя, пройдя через русское делопроизводство, стало звучать по-русски, но сохранило свою этническую и смысловую привязку.