Фамилия Чуднецов — одна из тех, где за привычным звучанием скрывается спорная этимология. Главный вопрос: от какого слова образована основа — от «чудо» или от «чудной»? Оба варианта возможны, но ведут к разным прозвищам.

Модель образования проста: суффикс -ов присоединился к основе Чуднец. В свою очередь, Чуднец — это либо форма имени, либо прозвище, образованное с помощью уменьшительного суффикса -ец. Чаще всего такие фамилии на -ец (Чуднец, Хитрец, Умнец) указывали на человека, который обладал яркой, бросающейся в глаза чертой характера. Если исходить из прилагательного «чудной» (в старом значении — странный, диковинный, необычный), то Чуднец — это «чудак», человек с причудами. Такое прозвище давали не в обиду, а как констатацию непохожести на других.

Вторая версия — от слова «чудо». Здесь Чуднец могло быть уменьшительной формой от канонического имени Чудо, которое изредка встречалось в древнерусской традиции как нецерковное, «охранительное» имя. Называя ребёнка Чудом, родители как бы желали ему необыкновенной судьбы или, наоборот, пытались «обмануть» злые силы, давая имя, которое не привлечёт внимания. Однако эта версия менее вероятна: фамилии от слова «чудо» чаще образовывались напрямую (Чудов, Чудин), а суффикс -ец здесь выглядит искусственным.

Стоит учесть и диалектную окраску. В некоторых северных и сибирских говорах «чудной» означало не просто странный, а «отличный, замечательный, удивительно хороший». В таком случае Чуднецов — потомок человека, которого уважали за редкие достоинства. Географически фамилия редкая, встречается разрозненно, без выраженного гнезда в одном регионе, что говорит о позднем и, вероятно, недворянском происхождении — скорее всего, из крестьянской или мещанской среды.