Фамилия Дарахунова — женская форма фамилии Дарахунов, и её происхождение связано с тюркскими языками, скорее всего, с татарским, башкирским или казахским. В основе лежит слово «дарахун» или близкое к нему «дарухан». Первое значение — «лекарство», «целебное средство» (от персидского «дару» — лекарство). Второе — «хан, дарующий лекарство», то есть целитель, знахарь, врач. В кочевых обществах такой человек был не просто лекарем, а часто и духовным наставником, знатоком трав и ритуалов.

Исходное слово могло быть прозвищем: Дарахун — так называли человека, который лечил, заговаривал болезни или просто славился знанием снадобий. В тюркской ономастике фамилии на -ов/-ев от прозвищ, образованных от профессий, — частое явление (ср. Бахшиев, Хаккыев). Суффикс -ов указывает на принадлежность: «сын Дарахуна». Таким образом, Дарахун — это родоначальник, чьё занятие или черта характера закрепились в имени.

Географически фамилия тяготеет к регионам Поволжья и Урала, особенно к Башкортостану и Татарстану. Встречается она и у сибирских татар. В русском контексте фамилия могла появиться при взаимодействии с тюркским населением или через крещёных татар, которые получали фамилии от прежних имён. Написание через «а» во втором слоге (Дарахунов, а не Дорухунов) характерно для татарского произношения, где звук «у» в безударной позиции редуцируется слабо.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Дараев, Дарханов — показывает, что корень «дар» в значении «лекарство» или «дар» (подарок) мог смешиваться. Но у Дарахуновых акцент именно на лечебном значении, что делает фамилию уникальной: она не говорит о богатстве или власти, а прямо указывает на древнюю профессию — целительство. В дореволюционной России носители такой фамилии могли быть как простыми крестьянами, так и представителями духовного сословия (муллами или знахарями), но сословная принадлежность по одной фамилии не определяется.

Единственный спорный момент — возможная связь с персидским «дара» (обладающий) и тюркским «хан». Тогда Дарахун — «хан-владелец», но эта версия слабее: суффикс -ун в тюркских прозвищах чаще образует названия профессий, чем титулов. Более правдоподобно, что предок был лекарем, а не правителем.