Фамилия Данахунова — редкая и звучит непривычно для русского уха. Её происхождение почти наверняка связано с тюркскими языками, и корень здесь — личное имя Данахун. Это имя составное: первая часть «дана» восходит к персидскому или арабскому «дана» (мудрый, знающий) или к тюркскому «дан» (слава, известность), а вторая часть «хун» — это вариант имени Хан (правитель, повелитель). Таким образом, Данахун можно перевести как «мудрый хан» или «знаменитый правитель». Имя было популярно у народов Средней Азии, татар, башкир.

Фамилия образована по русской модели с суффиксом -ов, который в женском роде даёт окончание -а. Это типичный способ русификации нерусских фамилий: к основе мужского имени или прозвища добавляли «-ов» (или «-ев»), чтобы получить фамилию в духе русской грамматики. Данахунова — это форма женского рода, а мужская версия будет Данахунов. Носительница такой фамилии — потомок человека по имени Данахун.

Географически фамилия скорее всего встречается в регионах, где исторически жили тюркские народы: в Татарстане, Башкортостане, в Средней Азии (Узбекистан, Таджикистан), а также среди астраханских или сибирских татар. Из-за редкости фамилии в общероссийских базах её точное распространение проследить сложно, но ономасты указывают, что подобные составные имена с компонентом «хан» были особенно распространены в среде знати или уважаемых людей.

В отличие от многих русских фамилий, которые образованы от прозвищ по ремеслу или внешности, Данахунова несёт в себе прямой отсыл к высокому социальному статусу предка. Имя Данахун могли дать в честь уважаемого старейшины, мудреца или местного правителя. С течением времени имя стало фамилией, закрепившись за родом.

Важно отметить, что суффикс -ов указывает на то, что фамилия оформлялась уже в русской канцелярской среде — например, при переписи населения или выдаче документов. Это значит, что предки носительницы фамилии, вероятно, жили на территории Российской империи и их имя было адаптировано под местные стандарты. Фамилия не имеет отношения к русским словам «дань» или «хан», хотя внешне похожа — её корень глубже и старше.