Фамилия Депелян — армянская, и её разумнее всего рассматривать в контексте армянской модели образования фамилий, а не славянской. Она относится к распространённому типу, где суффикс -ян (в древней форме -янц) указывает на принадлежность к роду. Первоначально такие фамилии означали «из семьи такого-то» или «из рода такого-то», то есть Депелян — это «из рода Депела».

Основа фамилии — личное имя Депел. Его корни уходят в древнетюркские языки, где слово tepel означало «белое пятно на лбу». Скорее всего, это было прозвище, данное по внешней примете: так могли назвать младенца, родившегося со светлым пятнышком на лице. В тюркской среде такие имена-описания были обычны, и имя могло перейти в армянский быт через многовековые контакты народов.

Важно не путать армянскую фамилию со славянскими формами вроде Депель или Депеля, которые могли бы образовываться от глагола «депелить» (драть, разделять) или прозвища «депела» (человек с бельмом на глазу). Для фамилии Депелян такая версия маловероятна, так как суффикс -ян однозначно указывает на армянское происхождение.

Первыми официально закреплённые фамилии в Армении получили представители высшей знати — Арцруни, Аматуни, Рштуни. Фамилии простых людей, в том числе и Депелян, оформились позже, когда возникла необходимость фиксировать родство для налогового и военного учёта. Таким образом, предки носителей этой фамилии были, вероятно, людьми незнатного происхождения, а их родовое имя пошло от наглядной особенности — белого пятна на лбу у кого-то из основателей рода.