Фамилия Десюн — одна из тех, чья основа уходит в украинскую или белорусскую традицию, а не в великорусскую. В ней нет привычного для центральной России суффикса -ов/-ев. Вместо этого перед нами суффикс -юн, который в восточнославянских языках часто указывал на принадлежность к роду или на характерный признак человека. Если бы фамилия строилась по модели «сын такого-то», она звучала бы как Десюненко (ср. с Иваненко — «сын Ивана»). Но здесь другая логика.

Основа «Дес-» — это, скорее всего, сокращённая форма от крестильного имени Десницкий или от прозвища Десна. В украинском и белорусском языках слово «десна» означает «правая рука» (отсюда и «десница»). Прозвище Десна могли дать левше (в насмешку), либо, напротив, человеку, который всё делал правой рукой — то есть ловкому, умелому. В таком случае Десюн — это «человек из рода Десны» или «сын Десны» (но не через суффикс -енко, а через -юн, что встречается реже: ср. Грицюн, Петрюн).

Есть и вторая версия, более прозаичная. В южнорусских говорах «десюн» могло быть диалектным вариантом слова «десёнок» — так в некоторых областях называли детёныша, подростка, а иногда и невысокого коренастого человека. Тогда фамилия Десюн — прямое прозвище по внешности или возрасту, без отчества.

Географически фамилия редкая. Основные следы ведут на запад Украины (Волынь, Подолье) и в южные области Беларуси, где суффикс -юн в фамилиях встречается чаще, чем в остальных регионах. Встречается также вариант написания Десюн с ударением на последний слог, что типично для польского влияния (ср. польск. Desiuń).

Спор между двумя версиями решается просто: первая (от прозвища Десна) правдоподобнее, потому что у неё есть параллели в ономастике. Фамилии от названий частей тела — не редкость (Головань, Носов, Щека), а «десна» как «правая рука» даёт осмысленное прозвище. Версия с «десёнком» слабее: слово не зафиксировано в основных диалектных словарях как устойчивое прозвище.

В итоге: предок носителя фамилии Десюн, вероятно, получил прозвище Десна (за ловкость или за то, что был левшой), а его потомков стали называть Десюнами — то есть «людьми из семьи Десны». Фамилия сохранила редкую словообразовательную модель, которая в XIX–XX веках почти исчезла под напором стандартных русских фамилий на -ов.