Фамилия Дезиденко — яркий пример того, как в русском языке прижились фамилии с нерусской основой, но по чисто русской модели. Её носители — почти наверняка потомки выходцев из Польши, Беларуси или Западной Украины, где католическое имя Дезидерий (от латинского Desiderius — «желанный») было в ходу. В православных святцах аналога нет, поэтому фамилия однозначно указывает на западное или униатское происхождение предка.

Суффикс «-енко» — типичный украинский патронимический формант, означающий «сын» или «потомок». То есть Дезиденко — это «сын Дезидерия». В XVII–XVIII веках такие фамилии активно формировались на Левобережной Украине и в Слобожанщине, куда переселялись и поляки, и русины. Если бы фамилия осталась в польском варианте, она звучала бы как Дезидеревич или Дезидерский, но украинская огласовка «-енко» выдаёт среду бытования.

Встречается фамилия редко, и это дополнительный ключ. В массовых переписях Российской империи Дезиденко не фиксировалась в центральных губерниях — её очаги, скорее всего, в Черниговской, Киевской или Волынской губерниях. Известных носителей с громкой исторической биографией нет, что типично для фамилий, возникших в среде рядового казачества или мещанства: имя Дезидерий не было аристократическим, его давали детям в надежде, что ребёнок будет «желанным», а не для подчёркивания статуса.

Любопытная деталь: в некоторых говорах имя Дезидерий могло сокращаться до Дезид или даже Зидя, поэтому не исключено, что фамилия образована не от полной формы, а от обиходного варианта — Дезид. Тогда Дезиденко — «сын Дезида», что звучит ещё более по-домашнему. В любом случае, фамилия хранит след конкретного человека, которого когда-то назвали редким латинским именем, и это делает её не похожей на соседние Ивановы и Петровы.