Фамилия Дикушкина — женская форма, а мужская, Дикушкин, образована по простой и распространённой модели: к основе прозвища или имени добавили суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — Дикушкин, то есть сын или потомок Дикушки). Сама основа — слово «дикушка» или «дикуш». В русских говорах так называли дикого, нелюдимого человека, отшельника, а иногда и просто необщительного ребёнка. В некоторых регионах «дикушкой» могли прозвать и домашнее животное, которое не шло к рукам, но применительно к человеку это устойчивое прозвище.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с уменьшительной формой редкого дохристианского имени Дик или Дык. Такие имена встречались в древнерусской антропонимии, но следов их широкого бытования почти не осталось. Поэтому версия с прозвищем выглядит убедительнее.

Географически фамилия тяготеет к центральным и северным областям России. Встречается в старых переписях Вологодской и Костромской губерний, где диалектное слово «дикуша» фиксировалось особенно часто. Носители фамилии, скорее всего, происходили из крестьянской или посадской среды: прозвища такого типа давали в деревне, а не в дворянских родах, где предпочитали именования по географическим названиям.

Суффикс -ин, а не -ов, тоже подсказывает, что основа оканчивалась на мягкий или шипящий звук — «Дикуш». В говорах такое окончание могло чередоваться: Дикуш — Дикушкин. Интересно, что в некоторых записях XVIII века встречается вариант Дикушкин с двойным «к» на стыке корня и суффикса, что объясняется народной этимологией — слово «кушка» (кошка) в уме носителей языка могло влиять на написание. Однако корень здесь именно «дик-», а не «куш-».