Фамилия Длугуканская — редкий случай, где географическая привязка оказывается важнее, чем значение корня. Если отбросить суффикс, основа «Длугукан» не имеет очевидных славянских или тюркских параллелей в значении «длинный» или «какой-либо каньон» (хотя «длуг» на польском и означает «долгий»). Скорее всего, перед нами топонимическая фамилия: её образовали от названия населённого пункта. Формант -ск- и окончание -ая типичны для польской шляхты или восточнославянской знати, но в данном случае указывают скорее на происхождение семьи из определённого места, а не на сословную принадлежность.

Наиболее правдоподобная версия связывает фамилию с деревней Длугукан (Długokąty) или похожим топонимом на территории современной Польши или Западной Беларуси. В польской ономастике суффикс -ан/-кан мог прирасти к основе в результате диалектных изменений. Например, «Długokąt» — «долгий угол» (участок земли), а в местном говоре могло закрепиться произношение «Длугукан». Владельца такого хутора или села называли «длугуканским», то есть выходцем из Длугукан. Со временем окончание подравнялось под женский род, как это часто бывает при закреплении фамилии за женщиной или при передаче по женской линии в документах.

Иной, менее надёжный вариант — происхождение от прозвища «Длугукан» (человек с длинными ногами или длинной шеей), но тогда фамилия скорее приняла бы форму Длугуканов или Длугуканский. Форма на -ская жёстко привязывает носителя к местности. Встречаемость фамилии крайне низкая, что подтверждает её локальный характер: скорее всего, все Длугуканские — потомки одной семьи из конкретного села, чьи предки переселились в Россию или Украину в XIX — начале XX века. Точное место установить без метрических записей сложно, но поиск стоит начинать с карт Гродненской или Виленской губерний.