Фамилия Дологунин с первого взгляда кажется составной: «долго» и «гун» или «гунеть». Но если присмотреться к суффиксу, картина проясняется. Форма на -ин указывает на происхождение от прозвища или имени, образованного от основы на -а/-я. То есть в основе лежало нечто вроде Дологуня — так в старину могли называть человека.

Самый вероятный корень — «долгий», но не в значении длины, а времени. В русских говорах «долгий» часто значило «медлительный», «тягучий». Прозвище Дологуня могли дать человеку, который делал всё неспешно, тянул с ответом или говорил протяжно, «гундел». Глагол «гунеть» (или «гунить») в диалектах как раз означает «говорить невнятно, тянуть слова, ныть». Дологуня — тот, кто долго и нудно тянет речь, «долго гундит». Вторая часть фамилии — не отдельное слово, а часть прозвищной основы, где «гун» — это корень, а «-я» — суффикс, характерный для личных прозвищ (ср. Молчуня, Ворчуня).

Менее правдоподобна версия, связывающая фамилию с тюркским словом «гун» (солнце) или именем Гуна. Для такой гипотезы нет ни географических, ни исторических оснований — фамилия Дологунин встречается почти исключительно в русских регионах, преимущественно в центральных областях России и Поволжье. Кроме того, суффикс -ин в русских фамилиях чаще всего присоединяется к основе, оканчивающейся на гласный, что подтверждает прозвищную модель Дологуня.

Встречается также вариант написания Дологунов, но форма на -ин более архаична и говорит о том, что прозвище было закреплено за конкретным человеком, а не за родом в целом. Сравним с однокоренными фамилиями: Долгих, Долганов — все они отталкиваются от того же «долгий», но Дологунин уникален своей глагольной окраской, описывающей не просто свойство, а поведение.

Таким образом, предок носителя фамилии Дологунин, скорее всего, был человеком, которого в деревне прозвали за манеру говорить медленно, тягуче или нудно. Прозвище закрепилось, перешло в фамилию и сохранило память о речевой особенности, которая когда-то выделяла его среди других.